伯尔尼大学位于瑞士中西部伯尔尼州的首府、瑞士首都伯尔尼市，地处德语区。伯尔尼是瑞士第四大城市，自从1848年在这里设立了联邦政府以来，一直是瑞士的政治和文化中心。阿勒河把伯尔尼分为西岸的老城和东岸的新城。伯尔尼素有熊城、泉城和手表王国的美称。作为瑞士农产品的集散地和铁路交通的枢纽，这里有铁路与苏黎士和日内瓦相通。伯尔尼位于法语区与德语区的交界处，语言以德语为主，但也讲法语。
伯尔尼大学目前有八个系，分别是：
神学系
法学系
经济学与社会学系
医学系
兽医系
哲学－历史系
哲学－自然科学系
哲学－人文科学系
此外，大学还设有两个系级机构：
一般生态学系际协调处
推广进修中心
